挿入・欠失・逆位・転座・置換検出法

開放特許情報番号:L2020001631 開放特許情報登録日:2020/8/17 最新更新日:2022/9/21

基本情報
出願番号
公開番号
WO2019/022019
登録番号
出願日
2018/7/23
公開日
2019/1/31
出願人
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
特許権者
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
権利化状況
権利化済
発明の名称
挿入・欠失・逆位・転座・置換検出法
開放特許情報
技術分野
食品・バイオ
機能
検査・検出
適用製品
配列情報、とりわけ、ゲノム等の生体分子の配列情報の情報処理の分野
目的
2つ以上の配列の間における多型を検出する方法が提供される。
効果
2つ以上の配列の間で正確に多型、特に欠失、挿入、逆位および/または転座を検出することができる。
技術概要
対象配列データにおいてコントロール配列データに対する多型を検出する方法であって、
a)対象配列データの配列中の少なくとも2ヶ所の部分配列の、コントロール配列上の位置を特定する工程と、
b)対象配列データにおける該部分配列間の位置関係と、コントロール配列上の該部分配列間の位置関係とを比較する工程と、
c)対象配列データにおける該部分配列間の位置関係と、コントロール配列上の該部分配列間の位置関係とが異なっている場合、目的とする多型があると判定し、該対象配列データにおける該部分配列部位間の文字を、対応するコントロール配列上の文字と、該部分配列部位を始点として順次比較して不一致となる部位を検出する工程と
を包含する、方法。
イメージ図
実施実績   :
許諾実績 :
特許権譲渡  :
特許権実施許諾:
登録者情報
その他の情報
関連特許
(国内):
(国外):
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