適用製品
配列情報、とりわけ、ゲノム等の生体分子の配列情報の情報処理の分野
目的
2つ以上の配列の間における多型を検出する方法が提供される。
効果
2つ以上の配列の間で正確に多型、特に欠失、挿入、逆位および/または転座を検出することができる。
技術概要
対象配列データにおいてコントロール配列データに対する多型を検出する方法であって、
a)対象配列データの配列中の少なくとも2ヶ所の部分配列の、コントロール配列上の位置を特定する工程と、
b)対象配列データにおける該部分配列間の位置関係と、コントロール配列上の該部分配列間の位置関係とを比較する工程と、
c)対象配列データにおける該部分配列間の位置関係と、コントロール配列上の該部分配列間の位置関係とが異なっている場合、目的とする多型があると判定し、該対象配列データにおける該部分配列部位間の文字を、対応するコントロール配列上の文字と、該部分配列部位を始点として順次比較して不一致となる部位を検出する工程と
を包含する、方法。